Kurz vor der großen Prisma-Schlacht treten der mysteriöse Shadow und Sonic in einem epischen Kampf gegeneinander an. Im heutigen New Yoke City entdeckt das Chaos-Kommitee Sonics mysteriöse Verbindung zu ihrer begehrten Energiequelle und plant, sie mit allen Mitteln zu extrahieren und für ihre finsteren Absichten zu nutzen. Wird es Sonic und seinen Freund*innen gelingen, dies zu verhindern?